但是這種形勢卻讓孫中山非常振奮，他不管百姓死活的，隻管自己到底能不能打倒北洋，奪得中華民國第一人的寶座，所以多次召集軍事會議，甚至製定了護法北伐的進兵戰略：令桂、滇兩軍肅清湘、川北軍，出師合擊武漢，其他各路護法軍、靖國軍也與桂、滇軍會師武漢，然後占領南京，大舉北伐，會攻北京，當然這個戰略看看就好，別當真，美夢仔好，也隻是夢，不會變真的。
說實話北洋軍在湖南的失敗不是敗給了護法軍，而是敗給了自己人，這種結果完全是是直、皖兩係矛盾分裂造成的，而且還加劇了這種矛盾。根本源頭就是自張勳複辟這場風波後，黎元洪被迫下台，副總統馮國璋代理總統，段祺瑞重任國務總理，當然上台當權的還是北洋軍閥，但是不一樣的是段祺瑞徹底把持著整個中央政府大權，而馮國璋不過是空頭把戲。
這樣子就又造成了新的“府院之爭”，直係首領、代總統馮國璋更是心生怨氣，一直和皖係首領段祺瑞爭奪北洋派正統地位及北京政府中央大權，這也就是北洋軍閥內部的直皖之爭，更為雄霸民國早期的北洋軍徹底解體創造了條件。段祺瑞在上台之後，接收到孫中山在廣州醞釀搞事的消息，決定先下手為強，於是任命皖係部下傅良佐為湖南督軍，打算先拿下湖南作為進攻兩廣的基地，但是他偏偏不願意讓自己的軍隊出現損失，於是一個陰招出來了，皖當領導，卻叫直係的軍隊去打先鋒，這不是明明白白的坑招呀！就是個小孩都能看明白。而馮國璋也不是個善茬，他也想借助西南軍閥的勢力來削弱皖係，兩人算是各懷鬼胎，但是段祺瑞手段更迅猛一點，馮國璋對段祺瑞利用直係軍隊打頭陣的部署更是不滿，於是直、皖的之間的矛盾越來越尖銳。
正是因為這樣，馮國璋看出了段祺瑞不懷好意，徹底的認清了他的真麵目，所以在段祺瑞主張“武力統一”的時候，馮國璋反其道而行之提出“和平統一”，當然是不想為他人做嫁衣，口頭上的話說明不了他的決心，當即指使湖南前線的直係軍隊消極怠戰，故意不攻，然後就在11月，湖南王汝賢、範國璋二人指揮直係軍隊在前線擅自停戰撤兵。而這次行動，打亂了皖係奪取湖南的戰略部署，算是徹底讓段祺瑞的謀劃付諸流水了。
對此，段祺瑞十分惱火，憤怒到向馮國璋提出辭職，可這有什麽辦法呢！難道你做初一還不允許別人做十五？這一昏招徹底讓馮國璋冒出的野心之火熊熊燃燒起來，於是馮國璋索性暗示號稱“長江三督”的湖北督軍王占元、江西督軍陳光遠、江蘇督軍李純發表聯名通電，主張南北雙方罷兵休戰，當然那三個都跟他沆瀣一氣，不過是弄給別人看的，或許他覺得這樣分量不夠，所以組織直隸、江蘇、江西、湖北的直係軍閥發表聯合通電，主張和平解決南北問題。
這個深水炸彈夠響亮，震驚全國，也震出了雄心，11月22日，馮國璋幹脆免去國務總理段祺瑞，任命王士珍為國務總理，因為段祺瑞武力統一南方的政策被馮國璋徹底打破了，所以他幹脆辭職，也顯得麵子上更好過，於是風靡全國多年的段祺瑞內閣再次倒台，但是，皖係軍閥有實力，又有日本的支持，他們對實力弱小的馮國璋停戰議和十分不滿，更是因為自家老大都被人欺負了，所以紛紛上電，於是直皖兩係公開分裂。
25日，馮國璋終於發現乾綱獨斷是什麽感覺了，那就是他今天提出的南北停戰令立馬就頒布全國了，可是這個乾綱獨斷僅僅得到他手下的直係的認同，殊不知比他實力更強的皖係正憋著一肚子火沒地方發呢！自己老大都被人莫名地捅了一刀，嗬嗬！還想要他們乖乖的聽馮國璋的話，你覺得可能嗎？當時整個皖係都實現了許久沒有看到過的眾誌成城，一致反對中央政府議和通電。
更為滑稽的是，馮國璋想議和，卻沒先和議和對象通電，剃頭挑子兩頭熱，有用嗎？這場戰爭的開啟權不在北洋軍一方，就連形勢也不利於北洋軍，在這種優勢下，試問換做你是孫中山，會接受馮國璋伸出的橄欖枝嗎？答案就是：就算他伸出的是金條都沒人願意，孫中山作為一個絕對的掛著民主牌子的強權主義者，可以說，在權力絕對掌控欲這一塊，他並不遜色於先前壟斷北洋政府大權的段祺瑞，正因為如此他才會迫不及待開戰，因為他背後有了德國的支持，並且按捺不住的野心絕不允許這種國家權柄再落入他人手裏。
所以他的回答就是：始終堅持護法，堅決反對南北調和，並且這樣的表明還不夠力度，當時督促中華民國革命政府在11月18日發表對時局的全國聲明:“舍恢複約法及舊國會外，斷無磋商餘地。”也是對自己戰鬥到底的表決，另一方麵，以程潛為首的湘軍將領湖南，本來就是想獨占，要知道這個時期的地域觀念還是很強的，所以馬上向廣東政府要求乘勝攻取嶽陽，鞏固護法軍在湖南的勝利說白了就是不滿足現有的地盤，換做我，我也不肯哪，偌大一個湖南被桂係占領大部，又被北洋軍占據一部分，至於他們占據的還沒北洋軍控製的湖南地盤多。
然而以擴張實力和地盤為目的的桂、滇兩係，在分別控製了湖南、四川兩省後，已經不想打了，唐繼堯和陸榮廷都不是傻子，既然擴張地盤的目的達到了，那就見好就收吧，有多大鍋下多少米，太貪吃怕是會消化不良，其實他們打算先徹底鞏固現有地盤再去尋思占領其他的防。所以誰都不理孫中山，說是不管護法運動的宗旨，其實就是不想為孫中山做嫁衣。