《行舟記》是一本長篇奇幻、曆史類小說，講述了少年馬十一在因緣巧合下誤入了一艘行走於六界之外的奇妙大船的故事。這艘大船徘徊在如霧似幻的十方海上，船內包羅萬象，好像一艘擁有生命的巨大迷宮，載著無數的人、鬼、妖去向不屬於他們的世界。這裏金碧輝煌，擁有著人世罕見的珠寶與財富，唯一沒有的就是“時間”，“死亡”是這裏最大的難題。
而少年馬十一卻似乎不受這個規則限製，在這裏，他還可以如以往一樣成長，這令在這活了上千年的拐子船長驚訝異常。漸漸地，他又結識了傳說中的惡僧法海、清朝的無頭畫師、唐朝的落魄將軍、以及徘徊於六界，千年無所事事的狐妖。隨著他們的友誼展開，一段又一段的往事也隨之一起浮出水麵。馬十一開解了他們的心結，令他們再一次擁有了新的人生。在這一切因果了結之後，馬十一終於發現了自己的秘密，這些秘密與拐子船長息息相關，似乎牽扯到了千年前的預言……